Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VhlP40338 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
VhlP40338 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VhlP40338 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
VhlP40338 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
VhlP40338 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
VhlP40338 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VhlP40338 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VhlP40338 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
VhlP40338 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VhlP40338 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VhlP40338 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
VhlP40338 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
VhlP40338 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VhlP40338 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VhlP40338 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VhlP40338 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VhlP40338 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VhlP40338 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VhlP40338 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VhlP40338 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
VhlP40338 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
VhlP40338 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
VhlP40338 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
VhlP40338 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
VhlP40338 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
VhlP40338 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
VhlP40338 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
VhlP40338 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
VhlP40338 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VhlP40338 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms