Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Nedd1P33215 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Nedd1P33215 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Nedd1P33215 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Nedd1P33215 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nedd1P33215 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nedd1P33215 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nedd1P33215 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms