Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgaP26339 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChgaP26339 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgaP26339 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms