Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P20040 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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