Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Tceal9-202ENSMUST00000113115 888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxd3P09027 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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