Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01649 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01649 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01649 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01649 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01649 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01649 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01649 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P01649 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01649 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01649 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01649 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms