Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
DffaO54786 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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