Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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