Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms