Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms