Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 272 ms