Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms