Protein–RNA interactions for Protein: J3QMH4

Gm21866, Predicted gene, 21866, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21866J3QMH4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21866J3QMH4 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms