Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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