Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms