Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms