Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms