Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms