Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV32

Arpc1b, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc1bQ9WV32 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc1bQ9WV32 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms