Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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