Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Kcnip3Q9QXT8 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Kcnip3Q9QXT8 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Kcnip3Q9QXT8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Kcnip3Q9QXT8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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Kcnip3Q9QXT8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Kcnip3Q9QXT8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Kcnip3Q9QXT8 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Kcnip3Q9QXT8 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Kcnip3Q9QXT8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Kcnip3Q9QXT8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Kcnip3Q9QXT8 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Kcnip3Q9QXT8 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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