Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Gde1Q9JL56 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Gde1Q9JL56 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Gde1Q9JL56 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Gde1Q9JL56 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Gde1Q9JL56 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Gde1Q9JL56 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Gde1Q9JL56 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Gde1Q9JL56 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Gde1Q9JL56 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms