Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.6 ms