Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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