Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tmem54Q9D7S1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tmem54Q9D7S1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Tmem54Q9D7S1 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Tmem54Q9D7S1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Tmem54Q9D7S1 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
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