Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms