Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms