Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Sgms2Q9D4B1 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Sgms2Q9D4B1 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Sgms2Q9D4B1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Sgms2Q9D4B1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Sgms2Q9D4B1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms