Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms