Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms