Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim26Q99PN3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim26Q99PN3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim26Q99PN3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim26Q99PN3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim26Q99PN3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim26Q99PN3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim26Q99PN3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim26Q99PN3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim26Q99PN3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim26Q99PN3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim26Q99PN3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim26Q99PN3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim26Q99PN3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim26Q99PN3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim26Q99PN3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim26Q99PN3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim26Q99PN3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim26Q99PN3 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim26Q99PN3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim26Q99PN3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim26Q99PN3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim26Q99PN3 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim26Q99PN3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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