Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GpnmbQ99P91 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms