Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brms1Q99N20 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms