Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms