Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms