Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms