Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms