Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Krt79Q8VED5 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Krt79Q8VED5 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Krt79Q8VED5 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Krt79Q8VED5 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Krt79Q8VED5 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Krt79Q8VED5 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt79Q8VED5 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms