Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms