Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q8VCE4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q8VCE4 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms