Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhsl1Q8CAF4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms