Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms