Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc2Q8BZW8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms