Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Nop53Q8BK35 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Nop53Q8BK35 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Nop53Q8BK35 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Nop53Q8BK35 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Nop53Q8BK35 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Nop53Q8BK35 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Nop53Q8BK35 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Nop53Q8BK35 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Nop53Q8BK35 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Nop53Q8BK35 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Nop53Q8BK35 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop53Q8BK35 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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