Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SnphQ80U23 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnphQ80U23 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnphQ80U23 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnphQ80U23 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnphQ80U23 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnphQ80U23 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnphQ80U23 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnphQ80U23 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnphQ80U23 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnphQ80U23 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnphQ80U23 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnphQ80U23 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnphQ80U23 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnphQ80U23 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnphQ80U23 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnphQ80U23 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnphQ80U23 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnphQ80U23 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnphQ80U23 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnphQ80U23 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Ube2uos-201ENSMUST00000142634 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Apela-202ENSMUST00000142822 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 A930031H19Rik-202ENSMUST00000153810 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 1700017D01Rik-201ENSMUST00000025635 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Olfr533-201ENSMUST00000071755 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm28813-201ENSMUST00000186293 1497 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm29324-202ENSMUST00000188242 1497 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnphQ80U23 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms