Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Clec18aQ7TSQ1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Clec18aQ7TSQ1 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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