Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynmQ70IV5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms