Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms