Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
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