Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nop58Q6DFW4 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nop58Q6DFW4 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nop58Q6DFW4 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nop58Q6DFW4 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nop58Q6DFW4 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nop58Q6DFW4 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms